По направлению «Здравоохранение» Департаментом осуществляется:

• оценка влияния различных мер государственной политики в сфере здравоохранения, обязательного медицинского страхования, на параметры экономического развития и бюджеты бюджетной системы Российской Федерации, условия ведения бизнеса;
• подготовка предложений по выработке государственной политики и совершенствованию нормативного правового регулирования по вопросам:
• стратегического планирования в сфере здравоохранения,
• повышения структурной  эффективности системы здравоохранения,
• функционирования системы обязательного медицинского страхования (включая вопросы сбалансированности системы с учетом тарифной политики и принимаемых обязательств), обращения лекарственных средств для медицинского применения, лекарственного обеспечения, снижения потребления алкоголя и табака, иным направлениям развития сферы здравоохранения.
• По направлению «Физическая культура и спорт» Департаментом осуществляется:
• оценки влияния различных мер государственной политики в сфере физической культуры и спорта на параметры экономического развития и бюджеты бюджетной системы Российской Федерации, условия ведения бизнеса;
• подготовка предложений по выработке государственной политики и совершенствованию нормативного правового регулирования по вопросам развития всех видов спорта, включая массовые, неолимпийские и национальные, повышения мотивации граждан к занятиям физической культурой и спортом.